泉州城北清源山，秦汉时就有方士、隐者的活动。西晋太康年间（280－289年），泉州最早的道教宫观白云庙在泉州府治南建置。佛教此时也在南安九日山下创建延福寺。　　唐景支二年（711年），泉州设置，经济发展，海外贸易逐渐发达，为多种宗教在泉州的传播提供了条件。大批道教宫观我佛教寺院相继创建。佛教在泉州的传播过程中，不断与泉州地方传统民俗文化相融合，逐渐形成具有泉州地方文化色彩的佛教文化。随着泉州港的兴起和海外贸易的发展，伊斯兰教和摩尼教也传入泉州。五代时，闽王政权推崇倡导道、佛二教，泉州的道教和佛教达到鼎盛阶段。　　宋代，最高统治者确立以儒、道、释合一为格局的中国文化传统。限制道教、佛教势力的发展，严格僧尼的剃度制度和道士的受箓制度，这样反倒提高了僧尼、道士的素质。所以宋代出现不少著名高僧和道士，也出现了不少著名的佛教、道教著作。宋祐二年（1087年），泉州设立市舶司，海外贸易十分活跃，社会繁荣，文化发达。佛教寺院积聚了大量的财富，因此出现历史上空前的佛教僧人造桥、造塔盛事，泉州开元寺著名的镇国塔、仁寿塔，以及著名的洛阳桥、安平桥，就是宋代僧人发起建造的。宋代，伊斯兰教、景教（基督教）都在泉州流传，阿拉伯人、波斯人在泉州建造了清净寺。　　元代，元廷对各门宗教采取兼收并蓄的态度，道教、佛教、伊斯兰教、景教和明教（摩尼教）可以自由传播，天主教和印度度也在元朝前期传入泉州，多种宗教在泉州共存并传播。这与元代泉州成为世界最大贸易港的地位是相适应的。　　穆圣的后裔典·乌马儿，景教徒乔治·阔里吉思，相继担任福建省（省治泉州）平章政事，驻扎泉州；对泉州伊斯兰教、景教的发展影响极大。泉州港主马八儿国挹伯鲁马尔，在泉州建造印度教湿婆神庙。泉州城内有三座欧洲人兴建的华丽的天主教堂。泉州伊斯兰教清净寺增至六七座。元廷派遣“管领江南诸路明教、秦教”的高级僧官西雷蒙驻扎泉州。管领泉州路景教僧官吴咹哆呢思，住持兴明寺。泉州开无寺有三千多僧人。
　　这一切表明，元代泉州是世界宗教的辐射点。　　元末，朝廷内讧，泉州港成为争夺的焦点，出现长达十年的“亦思巴奚”战乱，直至元亡。明初，泉州又出现盲目的排外运动，各门外来宗教受到严重摧毁。明末，天主教再度传入泉州，但因不尊重中国的传统文化，于乾隆年间被禁绝。鸦片战争后，根据不平等条约，基督教、天主教再度传入，对泉州教育、卫生带来影响较大。清末，日本教也传入泉州。　　新中国成立以后，实行宗教信仰自由政策。泉州的基督教、佛教、道教、伊斯兰教等，成立了种自的宗教组织。“文化大革命”中，停止一切宗教活动。1978年以后，泉州的各门宗教相继恢复宗教协会。恢复正常的宗教活动。